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结核病发病预测蛋白组特征的发现及其验证:一个前瞻队列研究背景

来源:2019-04-28

  一个能在结核病临床症状出现前预测健康人群向活动性结核病进展的非痰标本血液试验可以指导有目的的开展早期抗结核预防性治疗进而防止结核病的进一步传播。2019416日的《PLoS medicine》刊载了一项研究,旨在开发一种可供评估结核病进展风险的蛋白组生物标志物,并最终转化成一种床边的诊断手段(point-of-care diagnostic)。 

  方法学和结果 

  通过对20057月到20074月在南非开展青少年队列研究(Adolescence Cohort Study, ACS)进行主动病例发现(每半年开展一次)或被动的为期2年随访,发现了6363例结核感染,HIV阴性12-18周岁青少年对象,并将他们纳入一个纵向队列,研究发现了一组结核病发病风险蛋白组特征。在2年的随访期间,46例对象发展为细菌学确证的结核病例,这些患者组成进展组(progressors);106例随访期间保持健康的研究对象组成未进展组(nonprogressors)。运用一个高倍率蛋白质分析仪(SOMAscan),我们在血浆标本中定量了3000多种人类蛋白。在进展组和未进展组间发现了361种丰度可区分的蛋白。在ACS训练集中(ACS training set)发现了一个5-蛋白特征(TB Risk Model 5TRM5),并经ACS测试集(ACS test set)运用盲预测验证。由于TRM5在结核病确诊前13-24个月内预测价值欠佳,激励我们发现第二组3-蛋白特征(3-protein pair-ratio, 3PR),该蛋白特征是在全ACS亚队列(full ACS subcohort)中通过运用正交策略(orthogonal strategy)开发的。2组蛋白特征的预测效果经一个来自冈比亚的1948HIV阴性的结核病密切接触者(15-60周岁,66%为女性)独立队列(于基线,半年和18个月收集样本,并在20075月至201010月期间进行为期2年的纵向随访)进行验证。在这些密切接触者中,34例发展成细菌学确证的结核病例,并组成进展组;在2年随访期间保持健康的115例研究对象组成对照组(control)。ACS训练集中发现的TRM5蛋白组特征在结核病确诊前6个月内(受试者工作特征曲线[AUC]下区域为0.96[CI 95%, 0.93-0.99])和6-12个月内(AUC 0.76[0.65-0.87])的预测效果优良。冈比亚验证队列中TRM5在结核病确诊前1年内获得的AUC0.660.56-0.75)。3PR在整个南非发现队列(the entire South African Discovery cohort)中获得的结核病确诊前6个月内和7-12个月内的AUC分别为0.890.84-0.95)和0.720.64-0.81);同时3PR在冈比亚验证队列中获得结核病确诊前1年内的AUC0.650.55-0.75)。蛋白特征验证可能受到验证组试验同发现组试验比较时产生的信号幅度系统化改变(systematic shift in signal magnitude)的制约。有必要开展进一步的验证,特别是在非非洲国家队列中的验证,来评估这些蛋白组特征推广的潜力如何。 

  结论 

  以上发现的2个蛋白组结核病发病风险特征(proteomic TB risk signature)成功在结核病确诊前1年内对结核病发病过程进行了预测。据我们所知,这些是全球首批经验证的结核病发病预后蛋白组特征标记物。不过遗憾的是,2个蛋白组特征都没有达到世界卫生组织TPPs (目标产品目录) 对于结核病发病预后生物标记物的相关诊断标准。所以,还需要开展进一步的研究开发一种能在现实世界发现初期结核病患者(无症状),亚临床状态的结核病患者或活动性结核病患者的床边检测手段来尽早开始抗结核治疗。 

  

   (来源:结核帮) 

  原文出处:Penn-Nicholson A, Hraha T, Thompson EG, et al. Discovery and validation of a prognostic proteomic signature for tuberculosis progression: A prospective cohort study[J]. PLoS Med. 2019 Apr 16;16(4):e1002781. doi: 10.1371/journal.pmed.1002781. eCollection 2019 Apr. 

  链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30990820